Las Herramientas de Protésis no son más que verdaderas armas secundarias que, una vez encontradas, pueden ser equipadas en nuestro brazo mecánico a través del sabio trabajo del Escultor del Templo de Rovina. En el juego habrá diez Herramientas de Prótesis, y encontrarlos todos desbloqueará el trofeo de plata "Todas las Herramientas de Prótesis".
Hirata Summer
Herramienta de Prótesis #3 - Barril de Llama (Respiradero de Llama): Camino de Verano
Dónde encontrarlo: para desbloquear la región llamada Hirata Estate tendrá que hablar con una anciana, a quien encontrará en una casa destruida en las afueras de Ashina, situada entre las zonas de "Outskirts Wall - Gate Path" y "Outskirts Wall - Stairway". El personaje en cuestión le dará una pequeña campana, que podrá usar en el altar donde está el escultor (Templo en Ruinas).
Después del ídolo llamado "Sendero del verano", salta a través de las paredes del lado derecho hasta llegar a una gran zona con un arquero en un tejado y muchos enemigos alrededor de una hoguera. Dentro del fuego hay una herramienta, muy difícil de ver. Para recogerlo, básicamente, casi tienes que meterte en la hoguera. El escultor transformará este objeto en una herramienta de prótesis llamada "Flame Vent".
Herramienta de Prótesis # 4 - Hacha de Shinobi del mono (Hacha cargada): Camino de verano
Dónde encontrarlo: esta herramienta está muy cerca de donde encontraste la anterior. Desde la hoguera en la que tomamos el Flame Barrel, tendrás que tomar el camino de arriba (el que está vinculado al argumento del juego). Encontrará un soldado moribundo apoyado en una pared del lado derecho, que le hablará de un hacha.
Después de hablar con él, ve a la izquierda y entra en el siguiente patio donde encontrarás dos enemigos junto a una pequeña zona verde (los reconocerás porque puedes espiar su conversación). Mátalos y abre la casita del jardín que estaban mirando. La herramienta en cuestión estará ubicado en esta zona. El Escultor transformará el Hacha de Shinobi en la Herramientas de Prótesis Hacha Cargada.
Herramienta de Prótesis #5 - Plumas de Cuervo (Mist Raven): Pendiente de matorral de bambú
Dónde encontrarlo: después de matar al minibus "Shinobi Hunter Enshin of Misen", llegarás al ídolo llamado Bamboo Thicket Slope. Sigue el camino inmediatamente después de este ídolo, hasta que llegues a una pequeña serie de escaleras y luego agárrate al tronco del árbol de la izquierda. Luego salta al agua y nada contra la corriente hasta que llegues al final. En el lado derecho se puede agarrar una rama de un árbol y encontrar un objeto brillante para recoger (prácticamente al final del río).
A la derecha de este objeto hay una puerta/barricada de bambú. Golpearlo para destruirlo, revelando así el camino que llevará a una cueva. Escalar la pared de la cueva hasta llegar a un templo oculto en la cima de una montaña. Un poderoso ninja aparecerá en esta zona, pero por ahora puedes ignorarlo. Sólo abre la puerta del templo y dentro encontrarás esta herramienta, que el Escultor transformará en la herramienta de prótesis llamada "Niebla de Cuervo".
El castillo de Ashina
Herramienta de Prótesis #6 - El cuerno roto de Gyoubu (Lanza cargada): Castillo de Ashina
Dónde encontrarlo: desde el primer ídolo que se encuentra en esta región (llamado "Castillo Ashina"), salte desde el puente de la izquierda y agárrese a la rama del árbol. Aquí puedes escuchar a escondidas a dos enemigos que se encuentran en un puente. Mátalos y dejarán caer la Llave de la Casa de la Puerta. Desde el mismo puente donde los enfrentaste, baja por el lado derecho hasta llegar al ídolo llamado "Embalse de Ashina".
¿Recuerdas ese momento en el prólogo cuando nos mostraron cómo caminar escondidos en la hierba alta? Bueno, nos encontraremos visitando esa misma área, y ahí es donde estará la Casa de la Puerta. La única diferencia es que, esta vez, habrá un montón de fusileros y dos enemigos armados con grandes martillos patrullando la zona. Abra la puerta con la llave y, dentro, habrá un gran cofre del tesoro que contiene esta herramienta, que el escultor transformará en la "Lanza Cargada".
Herramienta de Prótesis #7 - Torre Superior - Antecámara
Dónde encontrarlo: desde el primer ídolo del castillo de Ashina, tendrás que saltar sobre los tejados del lado derecho y seguir las señales de humo que salen de ellos, hasta llegar a la gran torre en el centro del mapa (es el edificio más alto, fácil de ver). Al entrar en la torre a través de los tejados, encontrará el ídolo de la Anticámara. Ve a la habitación donde unos samuráis con túnicas azules patrullan la zona; salta de la torre desde este punto. En el fondo habrá cuatro enemigos y un cofre del tesoro en una habitación lateral. Dentro de este baúl encontrará la herramienta de prótesis que está buscando.
Herramienta de Prótesis #8 - Fortaleza de hierro (Paraguas cargado): Vieja tumba
Dónde encontrarlo: desde el ídolo de la Vieja Tumba, salta al lado izquierdo de un edificio con el techo roto. Pasa por el agujero en el techo y, en este edificio, encontrarás un mercader escondido. Este personaje le venderá la herramienta de prótesis "Fortaleza de Hierro" por 1600 Sen. Llévelo al escultor, que lo convertirá en el "Paraguas Cargado".
Valle Hundido
Herramienta de Prótesis #9 - Gran abanico (Secuestro divino): Fuerte de armas
Dónde encontrarlo: inmediatamente después del tercer ídolo del Valle Hundido, llamado "Fuerte de las Armas", entrará en una habitación donde tendrá lugar la lucha del jefe. Después de matar a este enemigo, encontrará el objeto que busca en esta misma habitación. El Escultor transformará lo que ha recogido en la herramienta de prótesis "Secuestro Divino".
Herramienta de Prótesis #10 - Silbato de dedo delgado: Valle del Bodhisattva
Dónde encontrarlo: se obtendrá automáticamente inmediatamente después de haber eliminado al jefe principal Mono Guardián. Este es el último jefe de esta zona, y tendrá que ocuparse de él para la continuación de la trama principal. El Escultor transformará el objeto que ha recogido en la herramienta protésica llamada "Silbato de Dedo".